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‣ Identificação de genes diferencialmente expressos em árvores de Eucalyptus grandis susceptíveis e resistentes à Puccinia psidii; Identification of differentially expressed genes in susceptivel and resistant Eucalyptus grandis trees exposed to Puccinia psidii

Salvatierra, Guillermo Rafael
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 29/05/2006 Português
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840.7273%
A atividade florestal apresenta-se como um vetor de desenvolvimento social, ambiental e econômico no Brasil. Em 2004 as exportações ligadas ao setor renderam US$ 7 bilhões e contribuíram com US$ 5,5 bilhões em impostos. No mesmo ano, no Brasil, dos 6 milhões de hectares de reflorestamento comercial, mais de 50% dos hectares são ocupados por eucalipto. Esta cultura pode ser utilizada para diversas funções, desde à produção de papel e celulose, até a produção de carvão vegetal. Mas a produtividade desta cultura atualmente tem uma série de fatores limitantes. Destes fatores, um dos mais severos é uma doença denominada ferrugem, causada pelo fungo Puccinia psiddii Winter. Este patógeno entre tanto, não é conhecido nos centros de origem do gênero Eucalyptus, mas, utiliza como hospedeiros vários gêneros das Mirtáceas, infectando folhas, flores e frutos em desenvolvimento. O controle da doença é normalmente realizado mediante o uso de fungicidas. Porém, a utilização de plantas resistentes é o método mais aconselhável por diversos motivos, como o baixo custo, a praticidade e o menor impacto ambiental. Neste trabalho a metodologia do SAGE - Serial Analysis of Gene Expression foi utilizada, para a análise da expressão gênica uma vez que permite detectar e quantificar...

‣ Caracterização molecular de genes preferencialmente expressos na fase leveduriforme patogênica de ´Paracoccidioides brasiliensis´ através das técnicas de ´Macroarray´ e de SSH (Suppression Substractive Hybridization) ; Molecular characterization of preferentially expressed genes in the yeast pathogenic phase of Paracoccidioides brasiliensis through the techniques of Macroarray and SSH (Suppression Subtraction Hybridization)

Marques, Everaldo dos Reis
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 22/12/2005 Português
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743.34266%
Paracoccidioides brasiliensis, um fungo termodimórfico, é o agente causador da paracoccidioidomicose (PCM), a micose sistêmica prevalente da América Latina. A patogenicidade aparenta estar intimamente relacionada com a transição dimórfica da forma de micélio para a de levedura, que é induzida pela mudança da temperatura do ambiente pela temperatura do hospedeiro mamífero. Há poucas informações disponíveis sobre genes de P. brasiliensis que são necessários durante a fase patogênica. Nós, então, realizamos as técnicas de SSH (“Suppression Subtraction Hybridization”) e de “Macroarray” com o objetivo de identificar genes que sejam preferencialmente expressos na fase leveduriforme do isolado Pb18. Genes identificados em ambos os procedimentos estão mais expressos na fase leveduriforme e estão envolvidos em metabolismo básico, transdução de sinal, crescimento e morfogênese e metabolismo do enxofre. Para testar se as mudanças observadas na expressão gênica refletem as diferenças entre as condições de crescimento usadas para obter as duas formas morfológicas preferivelmente às diferenças intrínsecas dos tipos celulares, nós realizamos experimentos com RT-PCR em tempo real utilizando preparações de RNA derivadas de ambas as fases...

‣ Isolamento e caracterização de genes diferencialmente expressos em insulinomas benigos humanos; Isolation and characterization of differentially expressed genes in human benign insulinomas

Krogh, Karin
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 14/02/2005 Português
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746.46914%
Os insulinomas são os mais comuns neoplasmas endócrinos pancreáticos, constituindo cerca de 17% de todos os tumores neuroendócrinos do trato digestivo. São tumores raros, que tem, como principal manifestação clínica, a hipoglicemia, a qual é ocasionada por secreção exagerada de insulina pelo tumor. Devido ao fato de serem tumores raros, o conhecimento das mudanças genéticas associadas à iniciação e progressão desses tumores é muito limitado. Em função disto, o objetivo deste trabalho é a identificação de genes diferencialmente expressos em insulinomas benignos humanos, visando o melhor entendimento dos mecanismos moleculares do processo tumorigênico dos insulinomas e a descoberta de novos alvos moleculares para terapia. Utilizando-se a plataforma de "bioarrays" CodeLink foram identificados 354 genes mais expressos nos insulinomas benignos, sendo que 16% estavam envolvidos em proliferação. Dentre estes genes foram escolhidos 6 genes para validação por "Real-Time PCR", onde os genes SPARCL1, PRSS11 STAT4, ECRG4, ASCL1 confirmaram sua expressão diferencial nos tumores, porém a diferença do gene IGFALS não foi estatisticamente significativa. Através da técnica "Representational Difference Analysis"...

‣ Experimentos de microarrays e teoria da resposta ao item; Microarryas experiments and Iten Response Theory

Neves, Carlos Eduardo
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 25/02/2010 Português
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754.00586%
Recentemente desenvolvida, a biotecnologia denominada por Microarrays permite o monitoramento simultâneo dos valores de expressão gênica de centenas de milhares de genes, fator este que traz uma nova interpretação aos resultados obtidos em pesquisas desenvolvidas nas mais diversas áreas do conhecimento incluindo, por exemplo, a Farmacologia e Medicina, uma vez que os resultados obtidos são interpretados ao nível molecular. Contudo, apesar de muita tecnologia ser empregada à técnica de Microarrays, sua aplicação ainda ocasiona algumas complicações decorrentes, por exemplo, das inúmeras fontes de variação existentes, da escala das respostas ou da natural dificuldade de se analisar uma grande quantidade de fragmentos genéticos avaliados sob poucas unidades experimentais. Frente a estas complicações, atualmente, muitas são as propostas metodológicas de análises estatísticas para atenuar ou eliminar os problemas inerentes à técnica de Microarrays e propiciar a extração de resultados mais confiáveis a partir dos valores de expressão gênica, porém muitos desafios ainda persistem. Sob esta colocação, o presente trabalho procurou explorar duas metodologias de análise estatística alternativas no que diz respeito a seus conceitos...

‣ Identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro envolvidos na resistência ao estresse hídrico; Identification of differentially expressed genes in common bean involved in drought stress resistance

Recchia, Gustavo Henrique
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 03/06/2011 Português
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759.856%
O Brasil é o segundo maior produtor de feijão, sendo a espécie mais cultivada o Phaseolus vulgaris L. Entre as três possíveis safras exploradas no Brasil, aquela que gera a maior produção é a da seca. Por outro lado, como a maioria das lavouras emprega pouca tecnologia, um dos problemas desta cultura é o estresse hídrico, que leva a uma redução na produtividade. Dessa forma, a identificação de genes que controlam os mecanismos de defesa e adaptação do feijoeiro à falta de água seria de grande utilidade. Nos últimos anos, muitas informações ômicas do feijoeiro foram geradas, criando uma visão integrada deste organismo e oferecendo uma complexa rede de interações entre genes e seus produtos. Este trabalho teve como objetivo central à identificação de genes diferencialmente expressos no sistema radicular de um genótipo de feijoeiro resistente ao estresse hídrico (BAT 477), quando submetido a uma interrupção de irrigação durante seu desenvolvimento. Foi construída uma biblioteca subtrativa de cDNA (SSH), que representou os genes diferencialmente expressos no genótipo resistente, utilizando-se como driver o genótipo Carioca 80SH (suscetível a seca). Foram obtidos 1572 reads válidos, sendo 931 destes singletons e 189 contigs com uma média de seis reads por cluster. A anotação das sequências foi conduzida via BLASTX...

‣ Genes cuticulares diferencialmente expressos durante eventos da metamorfose de Apis mellifera; Microarray analysis of genes expressed in the context of Apis mellifera metamorphosis

Soares, Michelle Prioli Miranda
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 06/07/2012 Português
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765.9364%
A cutícula dos insetos é composta principalmente por uma variedade de proteínas que interagem com filamentos de quitina, um polímero de N-acetilglicosamina, para formar um envoltório rígido que protege e dá forma ao organismo. O crescimento dos insetos depende da renovação periódica da cutícula, que se desprende durante a apólise e é digerida enquanto a epiderme sintetiza uma nova cutícula substituta. Tal renovação caracteriza a muda e metamorfose e é coordenada por hormônios, com destaque para os ecdisteróides. O atual trabalho objetivou caracterizar a expressão diferencial de genes do tegumento (cutícula e epiderme subjacente), além de elucidar aspectos de regulação e função no contexto da muda e metamorfose, com foco nos genes codificadores de proteínas estruturais e enzimas cuticulares. Para este fim, utilizamos o tegumento de fases específicas da muda pupal-adulta, isto é, de pupas (Pw), de pupas em apólise (Pp) e de adultas faratas (Pbl) para análises de microarrays de cDNA. As análises dos microarrays mostraram 761 e 1173 genes diferencialmente expressos nos tegumentos de adultas faratas (Pbl) em comparação com pupas (Pw) ou pupas em apólise (Pp), respectivamente. A categorização destes genes...

‣ Expressão de Ultrabithorax e o Desenvolvimento Casta-Específico de Apêndices Torácicos de Apis mellifera; Ultrabithorax Expression and Development of Caste-Specific Thoracic Appendages in Apis mellifera

Bomtorin, Ana Durvalina
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 12/04/2013 Português
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757.9808%
A diferenciação morfo-fisiológica entre rainhas e operárias de Apis mellifera decorre da alimentação recebida durante o desenvolvimento larval. Dentre as diferenças morfológicas entre as duas castas encontram-se estruturas especializadas para a coleta de pólen e própolis, localizadas nas pernas metatorácicas das operárias, ausentes nas pernas de rainhas. Os padrões de expressão de Ultrabithorax (Ubx) durante o desenvolvimento de operárias e rainhas estão associados aos padrões de cerdas das pernas de fêmeas adultas. Pernas mesotorácicas de operárias apresentam estruturas descritas como importantes na coleta de pólen, ausentes em rainhas. Por outro lado, as asas não possuem estruturas casta-específicas. No presente trabalho, análises globais de transcrição gênica por hibridação de lâminas de microarrays a partir de RNA total de pernas metatorácicas de operárias e rainhas em três estágios do desenvolvimento mostram 1952 genes diferencialmente expressos. Discos de pernas metatorácicas de larvas no início do quinto estágio larval, quando comparados aos de estágios mais tardios no desenvolvimento, têm alto níveis de transcritos de ativadores de Ubx, o qual está 25 vezes mais expresso em estágios subseqüentes do desenvolvimento. Buscas por motivos de ligação de fatores de transcrição nos promotores dos grupos de genes diferencialmente expressos revelam que os motivos para ligação de Ubx...

‣ Desenvolvimento de marcadores SSR e SNP em maracujá-doce a partir de uma biblioteca enriquecida com genes de resposta à Xanthomonas axonopodis; Development of SSR and SNP markers in sweet passion fruit from a library enriched for genes induced in response to Xanthomonas axonopodis

Costa, Zirlane Portugal da
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 15/07/2014 Português
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741.3976%
Um dos desafios atuais da pesquisa em frutíferas tropicais é incorporar abordagens baseadas em marcadores moleculares nos programas convencionais de melhoramento. O maracujá-doce (Passiflora alata) é uma espécie diploide, de fecundação cruzada e pouco explorada. Recentemente, nosso grupo construiu um mapa de ligação de P. alata composto de diferentes tipos de marcadores moleculares. Além disso, dispõe-se de um conjunto de transcritos de Passiflora edulis, obtidos a partir de duas bibliotecas de expressão: forward e reverse onde foram isolados transcritos diferencialmente expressos na planta inoculada com Xanthomonas axonopodis (Xap) (672) e na planta controle, não inoculada (310), respectivamente. Assim, neste estudo, este conjunto de transcritos foi explorado visando ao desenvolvimento de marcadores SSR e SNP com o intuito de enriquecer, posteriormente, o mapa de ligação de P. alata com marcadores funcionais putativos. Para o desenvolvimento dos marcadores SSRs, as 672 sequências da biblioteca forward foram investigadas e em 91 delas foram encontrados 115 SSRs. Como esperado, a classe de repetições trinucleotídicas foi a mais abundante, sendo o motivo (AG)n o mais comum entre as repetições dinucleotídicas. Desenhou-se primers para amplificar 42 desses SSRs. Dois acessos de P. edulis e seis indivíduos da população de mapeamento de P. alata foram usados nos testes de transferibilidade e avaliação do polimorfismo. Trinta e quatro pares de primers apresentaram bom padrão de amplificação...

‣ Identificação de genes diferencialmente expressos em tecido de paratireóide de pacientes portadores de hiperparatireoidismo primário: comparação entre hiperplasias, adenomas e carcinomas; Identification of differentially expressed genes in parathyroid tissue: comparison among hyperplasias, adenomas and carcinomas

Toscanini, Andrea Cecilia
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 11/03/2005 Português
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755.7369%
INTRODUÇÃO: Os mecanismos moleculares que levam ao desenvolvimento do hiperparatireoidismo primário (pHPT) ainda são desconhecidos. No entanto, alguns genes parecem ter seu papel definido na oncogênese das paratireóides, como os genes PRAD1 e MEN-1 que apresentam expressão aumentada em adenomas de pacientes com pHPT em relação ao tecido normal. Outro achado importante é a expressão aumentada do gene HRPT2 em carcinomas de paratireóide familiares ou não. A distinção entre hiperplasia, adenoma e carcinoma é difícil pelas limitações técnicas dos exames histo-patológicos atuais. Assim, este estudo tem como objetivo central identificar genes que possam servir como marcadores diferenciais entre hiperplasia, adenoma e carcinoma em pacientes com pHPT, com o intuito utilizá-los de forma auxiliar no diagnóstico diferencial destas condições. MÉTODOS: Foram empregadas três metodologias: 1) utilização de clones obtidos no Projeto Genoma Humano do Câncer (HCGP) que foram fixados em membrana e hibridizados com sonda ora de adenomas (n = 2) ora de carcinoma (n = 1). 2) utilização de membranas comerciais (Atlas© cDNA Expression Array Human Oncogene/Tumor Suppressor, Human Cancer 1.2. BD Biosciences Clontech. Palo Alto...

‣ Identificação de genes diferencialmente expressos em câncer de laringe

Colombo, Jucimara
Fonte: Universidade Estadual Paulista (UNESP) Publicador: Universidade Estadual Paulista (UNESP)
Tipo: Tese de Doutorado Formato: 136 f. : il.
Português
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754.3243%
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Pós-graduação em Genética - IBILCE; Os tumores de cabeça e pescoço ocupam, mundialmente, a quinta posição na lista das neoplasias mais freqüentes. O tipo histológico predominante é o carcinoma de células escamosas, que acomete a cavidade oral, a orofaringe, a hipofaringe e a laringe. O tumor de laringe é um dos tipos mais comuns, correspondendo a 25% dos casos, com alto índice de mortalidade e prognóstico reservado. O principal fator etiológico para o seu desenvolvimento é o consumo combinado de álcool e fumo. O desenvolvimento do câncer de cabeça e pescoço é um processo multipasso acompanhado por mudanças genéticas e epigenéticas. Recentemente, estudos envolvendo a tecnologia microarray têm identificado genes específicos, cuja expressão está alterada em câncer de cabeça e pescoço quando comparado ao tecido normal. No entanto, a maioria dos estudos são realizados usando tumores de diferentes sítios. Neste estudo, foi analisado somente amostras de carcinoma de laringe para minimizar as diferenças genéticas. Dessa forma, os objetivos do presente projeto foram identificar e validar possíveis biomarcadores moleculares envolvidos na carcinogênese de laringe. Para tanto...

‣ Metodos estatisticos para seleção de genes diferencialmente expressos a partir de dados de arranjos de DNA : aplicação a analise da expressão genica induzida em cana-de-açucar por deficiencia de fosfato; Statistical methods for the selection of differentially expressed genes from DNA array data : application to the analysis of the gene expression induced in sugarcane by phosphate deficiency

Rodrigo Drummond Couto Duarte
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 18/12/2006 Português
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763.3619%
Arranjos de DNA são uma poderosa técnica de monitoramento da expressão gênica em larga escala. No entanto, a grande quantidade de dados gerados com esse tipo de experimento requer um tratamento estatístico adequado às suas características. Uma aplicação importante dos arranjos de DNA é a identificação de genes diferencialmente expressos em diferentes amostras de RNA. Essa seleção demanda testes estatísticos apurados, capazes de distinguir, entre o grande número de genes usualmente presentes nos arranjos, aqueles cuja expressão é significativamente diferenciada. Neste trabalho nós desenvolvemos algoritmos para a análise estatística dos dados provenientes de arranjos de DNA, eficientes em lidar com os problemas usuais nesse tipo de dados, como o número limitado de réplicas. Aplicados a dados simulados, os algoritmos desenvolvidos mostraram-se competitivos com outros métodos de análises descritos na literatura, superando-os em algumas situações. A aplicação desses algoritmos foi também demonstrada em um experimento voltado à identificação de genes de cana-deaçúcar diferencialmente expressos em resposta a deficiência de fosfato. O fósforo é um macronutriente essencial, captado pelas plantas principalmente na forma de fosfato inorgânico (Pi). A deficiência de fosfato é freqüente na natureza...

‣ Genes diferencialmente expressos em celulas eritroides tratadas com hidroxiureia e potencialmente envolvidos com a reativação da sintese de hemoglobina fetal; Differentially expressed genes in hydroxyurea treated erythroid cells and potentially involved in the reactivation of fetal hemoglobin

Luciana Sarmento Moreira
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 14/08/2008 Português
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755.50016%
Anemia Falciforme (AF) é uma desordem hereditária das hemoglobinas, ausada por uma substituição de um único nucleotídeo adenina por timina (GAG?GTG), que resulta na presença de um aminoácido valina ao invés de ácido glutâmico na cadeia ? e na formação de uma hemoglobina anormal denominada hemoglobina S (Hb S). Hb S possui uma tendência de polimerização no estado deoxigenado. O grau de polimerização de Hb S na circulação determina o quanto um indivíduo terá crises vaso-oclusivas ou outro evento adverso. Altos níveis de hemoglobina fetal (Hb F) durante a vida adulta estão associados a uma melhora nos sintomas clínicos da AF devido à sua habilidade em inibir a polimerização de Hb S. Consequentemente, a busca por moduladores terapêuticos de Hb F continua a motivar a pesquisa básica e clínica, resultando em vários agentes farmacológicos que tem demonstrado um efeito no aumento da produção de Hb F. Hidroxiuréia (HU) é um fármaco que tem sido utilizado com sucesso na terapia de AF. Estudos multicêntricos demonstram que a administração de HU a pacientes com AF aumenta significativamente a produção de HbF e melhora os sintomas clínicos, pela redução da frequência de crises de dor e vaso-oclusivas...

‣ Genes diferencialmente expressos em Paracoccidioides brasiliensis

Borges, Clayton Luiz
Fonte: Universidade de Brasília Publicador: Universidade de Brasília
Tipo: Tese
Português
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752.58445%
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, 2008.; Paracoccidioides brasiliensis é um fungo termodimórfico causador da paracoccidioidomicose, uma doença endêmica na America Latina. A transição da forma miceliana (22°C) para forma levedura (36 °C) é induzida pela mudança da temperatura do ambiente para aquela no hospedeiro mamífero. Genes que são diferencialmente expressos nas fases de P. brasiliensis podem ser relevantes para o dimorfismo, e para o estabelecimento da infecção. No presente trabalho descrevemos a análise de genes diferencialmente expressos de P. brasiliensis. O gene da formamidase foi descrito como altamente expresso na fase miceliana de P. brasiliensis, isolado Pb01. Formamida aminohidrolase (formamidase, EC 3.5.1.49) catalisa a hidrólise específica da formamida para produção de amônia e formato. Nós identificamos a formamidase de P. brasiliensis, a qual reage com anticorpos presentes em soro de pacientes infectados com P. brasiliensis. O cDNA do gene foi clonado e a proteína heteróloga foi produzida e purificada. Adicionalmente, a proteína recombinante purificada foi reconhecida por soro de pacientes diagnosticados com paracoccidioidomicose e não reagiu com soro de indivíduos saudáveis. A proteína recombinante de 45-kDa foi cataliticamente ativa e sua atividade foi detectada em extratos protéicos das fases miceliana e leveduriforme de P. brasiliensis. A formamidase recombinante foi utilizada na produção de anticorpo policlonal em camundongos...

‣ Identificação de genes diferencialmente expressos em linfonodos de bovinos com diferentes níveis de resistência ao carrapato rhipicephalus (Boophilus) microplus.

IBELLI, A. M. G.; CARDOSO, F. F.; GENRO NETO, J. S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A.
Fonte: In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009 Publicador: In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE)
Português
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765.31055%
O carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus é considerado um dos maiores causadores das perdas produtivas de bovinos no Brasil e no mundo. Estimativas indicam perdas anuais de dois bilhões de dólares no Brasil. A variabilidade genética para resistência de bovinos ao carrapato tem sido verificada, demonstrando que há potencial para o melhoramento dessas características nessa espécie. Dessa maneira, o objetivo deste trabalho foi verificar a existência de genes diferencialmente expressos em bovinos resistentes e sensíveis ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Amostras de cinco animais classificados como resistentes ao carrapato e cinco animais classificados como sensíveis, dentro de quatro grupos genéticos, Nelore (NE), ½ Angus ½ Nelore (AN), ½ Canchim ½ Nelore (CN) e ½ Simental ½ Nelore (SN), foram coletadas após infestação artificial com o carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Foi feito o isolamento e purificação em coluna de sílica do RNA total e, posteriormente, as amostras foram submetidas à análise de expressão gênica em larga escala, pela técnica de microarranjos utilizando a plataforma Affymetrix. Os resultados obtidos dos chips de microarranjos foram submetidos à análise de qualidade por meio dos pacotes affy e affyqcreport do programa R. Posteriormente...

‣ Identificação de genes diferencialmente expressos durante a interação incompatível cafeeiro-Hemileia vastatrix.

GALLINA, A. P; ALMEIDA, R. F. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; FREITAS, F. de S.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S.
Fonte: In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. Publicador: In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Formato: Não paginado.
Português
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851.8474%
O trabalho teve como objetivo identificar genes envolvidos na resistência do cafeeiro contra Hemileia vastatrix, por meio da técnica de Hibridização Subtrativa par Supressão. Para isso, folhas do genótipo Híbrido de Timor CIFC 832/2 foram inoculadas com a raça II do fungo. Esse cafeeiro foi escolhido por ser resistente a todas as raças do patógeno identificadas ate 0 momento. Nos períodos de 12 e 24 horas após a inoculação, os RNAs de folhas inoculadas e não inoculadas foram coletados e os cDNAs sintetizados. A subtração dos cDNAs resultou em quatro bibliotecas contendo 528 clones. Esses clones correspondem a potenciais genes diferencialmente expressos em respostas a infecção do cafeeiro a H. vastatrix. As subtrações foram realizadas em ambas as direções, de forma a possibilitar a identificação de genes induzidos e reprimidos na interação incompatível. A análise da seqüência de 31 clones diferencialmente expressos indicou que muitos destes codificam proteínas envolvidas com a resposta de defesa de hospedeiro a fitopatógenos, como por exemplo, quitinases, proteases serina e endoxyloglucano transferase. A caracterização futura de outros clones das bibliotecas, bem como a comprovação do envolvimento dos genes por outras técnicas de genômica funcional contribuirão para 0 esclarecimento do mecanismo molecular envolvidos na defesa do cafeeiro a H. vastatrix...

‣ Identificação e quantificação da expressão de genes diferencialmente expressos sob condição de déficit hídrico em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris).

FARIA, B. M. S. de; PAPPAS JUNIOR, G. J.; GUIMARÃES, C. M.; CARVALHO, P. F. Z.; VIANELLO, R. P.
Fonte: In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 10., 2011, Goiânia. Anais... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. Publicador: In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 10., 2011, Goiânia. Anais... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão, 2011.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Formato: 1 CD-ROM.
Português
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749.5229%
Com o intuito de avançar no conhecimento dos mecanismos genéticos envolvidos na tolerância à seca, esse estudo teve como objetivos a identificação de genes diferencialmente expressos em feijoeiro comum sob condições de déficit hídrico, validação via RT-PCT de alguns desses genes-candidatos potencialmente envolvidos na resposta ao estresse, bem como contribuir para o incremento do banco de sequências expressas (EST?s) enriquecidas para genes diferencialmente expressos nos genótipos BAT 477 (tolerante) e Pérola (suscetível) quando submetidos às condições de presença e ausência do déficit hídrico.; 2011; CONAFE.

‣ Detecção de genes diferencialmente expressos na formiga urbana Camponotus vittatus (Hymenoptera, Formicinae)

Rodovalho, Cynara de Melo
Fonte: Universidade Federal de Uberlândia Publicador: Universidade Federal de Uberlândia
Tipo: Dissertação
Português
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765.3277%
Insetos sociais despertam grande curiosidade, interesse e uma vontade de se compreender as bases moleculares da vida social. A identificação de genes diferencialmente expressos tem sido usada para o entendimento não só da função gênica, mas também dos mecanismos moleculares de diferentes processos biológicos. Nesse estudo, foram testados dois protocolos para extração de RNA total de Camponotus vittatus e a técnica de Differential Display Reverse Transcriptase – Polymerase Chain Reaction (DDRT-PCR) foi utilizada para a identificação de genes diferencialmente expressos em casta, sexo e nos estágios de desenvolvimento dessa formiga. O método de extração de RNA baseado em Chomczynski e Sacchi (1987) demonstrou ser o mais eficaz. A técnica DDRTPCR foi eficiente para a detecção de genes diferencialmente expressos de C. vittatus. Três expressed sequence tags (ESTs) foram seqüenciadas e análises por bioinformática não detectaram similaridade com seqüências depositadas em banco de dados, podendo ser novas e, talvez, específicas de C. vittatus. Essas seqüências foram depositadas no banco de dados dbEST. Um fragmento diferencialmente expresso em operária foi obtido com a combinação dos primers: HT11G e AP03. Os resultados do seqüenciamento e das análises por bioinformática revelaram que tal EST foi isolada da bactéria endossimbionte de C. vittatus...

‣ Caracteriza????o morfo-fisiol??gica e identifica????o de fragmentos de cDNA diferencialmente expressos de tegumentos de sementes de soja com permeabilidade contrastante; Morpho-physiologic characterization and identification of fragments of cDNA distinguishing expressed in soybean seed coat with contrasting permeability

MERTZ, Liliane M??rcia
Fonte: Universidade Federal de Pelotas; Agronomia; Programa de P??s-gradua????o em Ci??ncia e Tecnologia de Sementes; UFPel; BR Publicador: Universidade Federal de Pelotas; Agronomia; Programa de P??s-gradua????o em Ci??ncia e Tecnologia de Sementes; UFPel; BR
Tipo: Dissertação Formato: application/pdf
Português
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761.9405%
Some works have reported the existence of contrasting soybean genotypes for physiological quality of seeds. There are such differences because of the presence of seeds with total or partial impermeability for water absorption into the coat that make them less susceptible to mechanical damages, weather adversities, deterioration by humidity and pathogen occurrence. The characteristic of semi-permeable coat can be used in programs of soybean crop breeding to be incorporated in genotypes of high production, aiming at the physiologic quality of the seed. The objectives of this study were: Identify structural differences among the coat of the genotypes CD-202 (permeable) and TP (semi-permeable); obtain fragments of genes distinguishingly expressed among the coat of those genotypes; characterize the physiological quality of soybean seeds produced. Morphologic characterization of the coats was carried out by optic microscope BX 51 with increase of 40x. In order to obtain the fragments of genes distinguishingly expressed among the coats of the two genotypes, the technique cDNA AFLP was used. The physiological quality of the seeds was obtained by germination tests and vigour (accelerated ageing and electrical conductivity). Besides, structural differences were observed among the coats of the two genotypes...

‣ Avaliação de genes diferencialmente expressos em Xylella fastidiosa em condições de adesão

Camila Caldana
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 11/09/2002 Português
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Xy/ella fastidiosa é uma bactéria Gram-negativa, limitada ao xilema, responsável por doenças em culturas de grande importância econômica, como a clorose variegada dos citros no Brasil e a doença de Pierce em videira. Devido à colonização de micro ambientes específicos sujeitos a uma forte pressão, supõe-se que a bactéria possua mecanismos de agregação entre células e entre essas e a parede dos vasos colonizados. Tal interação pode estar associada com sua patogenicidade. Assim, este trabalho teve por objetivo a avaliação dos genes diferencialmente expressos de X. fastidiosa em resposta a uma condição de simulação de adesão in vitro, através da análise de "microarrays" e do padrão 2D-PAGE de proteínas. A estirpe 9a Sc foi cultivada nas seguintes condições: bactérias planctônicas (C) x bactérias crescidas em suspensão em meio com lâminas de lenho (S) e C x bactérias aderidas às lâminas de lenho (L). Foram realizadas curvas de crescimento para padronização da fase exponencial, determinada de 4 a 6 dias para C e S e de 6 a 8 dias para L. Para a análises de microarranjos, os experimentos C x S, não foram encontradas diferenças significativa na de expressão no conjunto de genes avaliados. Enquanto em C x L ...

‣ Identification of genes differentially expressed in breast cancer; Identificação de genes diferencialmente expressos no cancro da mama

Reis, Vânia Isabel Gonçalves Pereira dos
Fonte: Universidade da Beira Interior Publicador: Universidade da Beira Interior
Tipo: Dissertação de Mestrado
Publicado em /06/2012 Português
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Breast cancer comprises heterogeneous tumors with different clinical characteristics, disease courses, and responses to specific treatments. Moreover, breast carcinomas result mainly from the accumulation of genetic and epigenetic alterations in epithelial cells of mammary gland. The identification of novel genes differentially expressed in breast cancer has important implications in understanding the molecular mechanisms underlying breast tumorigenesis, and developing new diagnostic and therapeutic targets. Therefore, the aim of this work was to identify genes differentially expressed in the breast cancer MCF7 cells, and to confirm its differential regulation in breast cancer. In this study, we used the suppressive subtractive hybridization technique to generate two subtractive libraries with 96 clones each, which were subsequently digested with EcoRI and then, all the plasmids with insert were sequenced. These results were further analyzed by Blast tool and GeneBank. We identify 36 genes as overexpressed and 19 genes as underexpressed in MCF7 cells. Some of these genes were previously identified as over- or underexpressed in breast cancer; however we found several genes that haven’t yet been described as up or down-regulated in MCF7 cell line. In the future...